圣战刚刚结束，白羊座史昂、天枰座童虎是这场圣战幸存的唯二的黄金圣斗士，为了准备迎接下一次圣战，他们接受了雅典娜的使命：史昂以教皇的身份留守圣域，而童虎则凭借雅典娜赐予的假死法（misopetha-menos）坐在中国庐山五老峰的大瀑布下监视封着一百零八个魔星的塔。
  圣域正在重建工作中，身为金牛座哈斯加特的弟子提纳奥在哈迪斯布下的结界陷阱之中奇迹般地生还了，圣战结束后，重伤的提纳奥支撑着返回圣域，在金牛宫见到了准备前往五老峰的童虎，后在教皇厅见到了新任教皇史昂，并与史昂一起开始了战后圣域的重建工作。
  圣战结束6年之后，提纳奥已经成长为新一代的金牛座黄金圣斗士，在重建圣域的某日里，机缘巧合，用巨型号角救下了替圣域配送药材的塞琳莎和阿加莎（曾被双鱼座·雅柏菲卡救下的罗德里奥村少女）一行人。之后，提纳奥被史昂派遣前往西西里岛，去打倒曾经被压在埃特纳火山之下，现在试图挣脱封印的邪恶巨人。
  就在提纳奥出发后的当天晚上，史昂感受到了一股强大小宇宙的气息，令人惊讶的是这股小宇宙与处女座星座产生了共鸣，史昂根据这股小宇宙的气息，进行瞬移，目的地的终点是圣域附近的一片寂静无人森林的中心位置，这股强大的小宇宙的主人竟是一个刚出生不久的婴儿。
  “是被遗弃了吗？”
  史昂把婴儿抱了起来，小婴儿还在不停的散发着小宇宙，‘是感到不安而散发出小宇宙的吗’。
  “没事，我就在这里，我会保护你的。”史昂也散发出自身的小宇宙来安抚婴儿。
  也许是婴儿感受到了史昂的安抚小宇宙，小宇宙逐渐变得平稳，也许可能是听到了是史昂说的话，婴儿露出来笑容，就在下一秒，以抱着婴儿的史昂为中心，白色的花瞬间出现向四周散去。
  “！？这是睡莲？！”史昂一下子就认出来花的品种。‘这孩子的未来不可小视啊’
  “从今天起你的名字就是墨莲。”史昂看着拥有黑色的发色的孩子和纯白的睡莲联想到了‘墨莲’这个名字。
  漆黑安静的夜晚，在皎洁的月光下，身着教皇法衣男子怀中抱着一个婴儿，站在一片洁白花海中，这是一个命运的一切的开端……